Berdasarkan Hasil Penyaringan Calon Rektor yang dilakukan oleh Senat Universitas Cenderawasih pada tanggal 21 Juni 2021 telah diperoleh tiga (3) nama Calon Rektor sebagai berikut:
| Nomor Pendaftaran | Nama Calon Rektor |
| 1. | Dr. Ir. Apolo Safanpo, ST, MT. |
| 2. | Dr. Septinus Saa, S.Sos., M.Si. |
| 3. | Dr. Ir. Johni J. Numberi, ST, M.Eng. |
